基础课程
初中部全面实施国家规定的文化基础课程，主要包括语文、数学、英语、物理、化学、历史、道法、体育、地理、生物、音乐、美术、信息技术，心理等 13 个学科。学校以“清北”名师为主带动全体教师，强调“绿色育人”，通过基础课程的教学，使学生掌握当今社会必备的基础知识和基本技能，为学生适应中高考打下坚实基础。另外，初中部将把“心理课”纳入课程表，作为国家基础课程的补充。
特色课程
初中部特色课程体系主要围绕两个特点进行搭建：
1.中西文化融合，彰显外语特色。即提炼中国教育和西方教育各自的优势，利用中国教育夯实基础，利用西方教育开拓视野，最大化地实现两者间的优势互补。初中部将专门聘请优秀外籍教师担任所有年级的英语口语课，每个班每周至少开设1+1外教英语课，每周至少课程表和活动课程各一节，并设立周三“纯英语交流日”，每周举行一次由外教团队组织的英语活动。初中部计划从八年级开始，学生可以选修第二外语（德语和日语）。
2.科学与人文素养并重。即实施stem教育，加强人文博雅及艺术特长的培养。
社团课程
初中部以课程多样性为特征，以培养学生创造思维为核心，以学生自主组建为主要形式，开设了8大类30余种社团课程。具体如下：
1.体育类：健美操俱乐部、跆拳道俱乐部、篮球俱乐部、足球俱乐部、羽毛球俱乐部和乒乓球俱乐部等；
2.棋类：中国象棋班、国际象棋班、围棋班等；
3.艺术类：乐之韵俱乐部、舞之魅俱乐部、合唱队、管弦乐队、书法社、国画社、版画社等；
4.文学语言类：东江之珠文学社、课本剧团、东江之声广播站、校园小记者、东实主持等；
5.信息技术类：网页制作俱乐部、人工智能、创客活动、编程班等；
6.社会科学类：东实史学社、模拟法庭等；
7.素养类：女子素养班，男子训练营，国学班等；
8.其他类：将根据学生需求增设一些其他社团课程，如动漫社、陶艺社、摄影社团等。
拓展课程
学部围绕初中学生智力差异性和兴趣多样性，开设两大类拓展课程。
1.学科类拓展课程：各学科的培优辅弱班，各学科竞赛辅导班。确保“学业优异”，打牢“清北”基础；
2.社会类拓展课程：通过游学、研学，国内外交换生等形式，中外融合，培养国际化人才。
